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BD Rhapsody單細胞3'轉錄組+膜表面(mian)蛋白(bai)檢測
產品簡介
單(dan)(dan)細(xi)胞(bao)轉(zhuan)錄組測序如何進行單(dan)(dan)細(xi)胞(bao)的(de)捕獲(huo)，是(shi)(shi)決定單(dan)(dan)細(xi)胞(bao)檢測成本(ben)和通量的(de)關鍵(jian)步驟(zou)。高通量單(dan)(dan)細(xi)胞(bao)捕獲(huo)目(mu)前主流(liu)的(de)有兩大(da)策略，一種(zhong)是(shi)(shi)以10x Genomics為代表的(de)采(cai)用(yong)微流(liu)控芯(xin)片(pian)技(ji)術（Microfluidic） ，另一種(zhong)，就是(shi)(shi)BD Rhapsody為代表的(de)采(cai)用(yong)微孔板（Microwell） 技(ji)術。 BD Rhapsody單(dan)(dan)細(xi)胞(bao)分析(xi)系統包括BD Rhapsody卡式芯(xin)片(pian)、 BD Rhapsody上樣(yang)臺、 BD Rhapsody掃描(miao)儀三(san)大(da)部(bu)分。
BD Rhapsody上(shang)樣臺（左）； BD Rhapsody卡(ka)式(shi)芯(xin)片（中(zhong)）； BD Rhapsody掃描(miao)儀（右）
技術原理
BD RhapsodyTM 卡式芯片由上萬個微孔組成，主要承擔樣本以及試劑的添加，在平面卡式芯片上，一個細胞與一個條碼標記微球（beads） 依次落入同一個微孔中，細胞裂解釋放mRNA并且與磁珠上的引物序列雜交，進而完成細胞的捕獲和mRNA反轉錄。磁性回收beads，抓取cDNA進行文庫構建并測序。接下來采用BD RhapsodyTM 單細胞分析系統進行數據分析，一次可以獲得100~10,000個單細胞的基因表達數據，實現單細胞水平鑒定和表征細胞類型的目的。
BD Rhapsody 微(wei)孔捕獲(huo)及標(biao)記(ji)細胞原(yuan)理
BD Rhapsody 單細(xi)胞測序實驗流(liu)程圖
BD Rhapsody 單細胞表面蛋白檢測
結果展示
細胞分(fen)群圖（左）； 蛋白表達密度分(fen)布圖和熱圖分(fen)析（右）
Marker 基因聚類熱(re)圖（左）； 基因表達擬時間分析（右）
產品優勢
超(chao)高通(tong)量
每個(ge)樣可(ke)檢測100-10,000個(ge)細胞(bao)；
多組學檢測
可以同時實現(xian)靶(ba)向mRNA+ 蛋白質(zhi)+ VDJ CDR3的單細胞多組(zu)學研究(jiu)；
系統可靠
可利(li)用成像(xiang)系統對(dui)單細(xi)(xi)胞捕(bu)獲過(guo)程進行質控(kong)；單細(xi)(xi)胞捕(bu)獲效率高達80%，多細(xi)(xi)胞比例(li)<1%(1,000個細(xi)(xi)胞中)；
經驗豐富
百奧醫藥技(ji)術團隊現已累積100余(yu)種不同組織類型、數千(qian)余(yu)個樣品的單細胞(bao)測序(xu)經驗。
送樣要求
應用方向
應用案例
單細胞測序揭示HIV慢(man)性感染(ran)MAIT細胞功能損傷新機(ji)制(zhi)
Sustained IFN-I stimulation impairs MAIT cell responses to bacteria by inducing IL-10 during chronic HIV-1 infection
發表(biao)雜志：Science Advances （IF: 14.136）； 發表時間： 2020年 2月； 應用技(ji)術：BD Rhapsody單(dan)細胞轉錄組測(ce)序(xu)， BD Rhapsody單(dan)細胞表面蛋白檢測(ce)
HIV-1感(gan)染者的(de)(de)(de)(de)粘膜相(xiang)關(guan)恒定T細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)（MAIT） 會(hui)發(fa)生功(gong)(gong)能受損，其機制(zhi)(zhi)尚不清楚。單(dan)細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)轉錄組(zu)結合表面蛋(dan)白(bai)分析顯示，與健康個體相(xiang)比，隨著干擾素（IFN） 刺激基因(yin)上(shang)調， HIV-1感(gan)染者的(de)(de)(de)(de)外(wai)(wai)周MAIT細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)被高度激活。持續的(de)(de)(de)(de)IFN-α作(zuo)用，通過觸(chu)發(fa)單(dan)核(he)細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)產生高水平(ping)IL-10，抑(yi)(yi)制(zhi)(zhi)了MAIT細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)對大(da)腸(chang)桿菌(jun)刺激的(de)(de)(de)(de)應答, 進(jin)而抑(yi)(yi)制(zhi)(zhi)IL-12（一個關(guan)鍵的(de)(de)(de)(de)MAIT細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)活化共刺激細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)因(yin)子）的(de)(de)(de)(de)分泌。阻(zu)斷IFN-α或(huo)IL-10受體，可以(yi)體外(wai)(wai)阻(zu)止(zhi)HIV-1暴露引起的(de)(de)(de)(de)MAIT細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)功(gong)(gong)能障(zhang)(zhang)礙。此外(wai)(wai)，阻(zu)斷IL-10受體可顯著改善HIV-1感(gan)染者MAIT細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)的(de)(de)(de)(de)抗結核(he)應答。研究發(fa)現證實了IFN-I/IL-10軸在(zai)HIV-1患者MAIT細(xi)(xi)(xi)(xi)胞(bao)(bao)功(gong)(gong)能障(zhang)(zhang)礙中的(de)(de)(de)(de)中心作(zuo)用，這(zhe)對開發(fa)針對HIV-1患者細(xi)(xi)(xi)(xi)菌(jun)共感(gan)染的(de)(de)(de)(de)抗IFN-I/IL-10策略(lve)具有意義。
T細胞亞群的單細胞轉錄和表(biao)面蛋白表(biao)達譜(pu)（左(zuo)）； 基因(yin)和蛋白的差異(yi)表(biao)達分析(xi)（右）
IFN-I信(xin)號與(yu)HIV-1感(gan)染MAIT細胞(bao)功能(neng)障礙的相關性
