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Mission Bio單細胞基因組測序（SNV+CNV）
背景介紹
單細胞(bao)(bao)測(ce)序技術的(de)快速(su)發展極大(da)地加速(su)了生(sheng)物(wu)醫(yi)學領域的(de)相(xiang)關研究(jiu)，幫(bang)助(zhu)科研人員(yuan)克服了生(sheng)物(wu)樣本內異(yi)質性等重大(da)挑戰，然而先前的(de)單細胞(bao)(bao)測(ce)序優勢(shi)主要集中在高通(tong)量獲取單細胞(bao)(bao)轉錄組信(xin)(xin)息，對(dui)于高通(tong)量的(de)捕獲基因組以(yi)及多組學信(xin)(xin)息較為(wei)欠(qian)缺。 Mission Bio Tapestri平(ping)臺可(ke)以(yi)在單細胞(bao)(bao)水平(ping)，高通(tong)量的(de)檢測(ce)來自同一細胞(bao)(bao)的(de)SNV、 CNV以(yi)及蛋白(bai)質數據，提供(gong)單細胞(bao)(bao)多組學解決(jue)方(fang)案，這(zhe)將進一步(bu)提高對(dui)細胞(bao)(bao)間異(yi)質性的(de)理解，提供(gong)細胞(bao)(bao)和遺傳組成的(de)獨特見解。
單細胞(bao)基因(yin)組測序和(he)傳統測序的區(qu)別
技術原理
Mission Bio的(de)Tapestri平臺基(ji)于微液滴(di)的(de)微流(liu)控(kong)裝(zhuang)置，利用油包(bao)水(shui)體系對(dui)細(xi)胞進(jin)行捕獲與封裝(zhuang)。封裝(zhuang)時，細(xi)胞和蛋(dan)白(bai)酶(mei)等會被一(yi)起裝(zhuang)入微液滴(di)中，每一(yi)個(ge)微液滴(di)相當于一(yi)個(ge)微容(rong)器。之后(hou)，細(xi)胞在微液滴(di)中進(jin)行裂解、加(jia)條形碼（barcoding）等步驟，再(zai)結(jie)合靶向(xiang) PCR 擴增技術(shu)，對(dui)特定的(de)DNA 目標(biao)序(xu)列與蛋(dan)白(bai)產物(wu)進(jin)行單細(xi)胞水(shui)平的(de)建庫。建庫完成后(hou)，即可(ke)進(jin)行高通量測序(xu)和后(hou)續的(de)生物(wu)信息學分析。
Mission Bio DNA單(dan)細胞平臺原理
Mission Bio 單細胞基因組測序（SNV+CNV）
結果展示
細(xi)胞分(fen)群圖(tu)(tu)（左）； 聚類熱圖(tu)(tu)（中）； 小提(ti)琴圖(tu)(tu)（右(you)）
相關性分析（左）； 突變共發(fa)生魚(yu)形圖（中）； 克隆(long)進化分析（右(you)）
產品優勢
超高通量
可對(dui)每個樣本的(de)5,000-10,000個細胞(bao)進行多組學(xue)分析；
平臺唯一
目前唯一(yi)的(de)高通量(liang)單(dan)細(xi)胞DNA（SNV、 InDel、 CNV、 LOH和(he)易位）檢測平臺，唯一(yi)的(de)高通量(liang)單(dan)細(xi)胞DNA和(he)蛋
白質聯合檢測平臺；
高靈敏度
能檢測到0.1%亞克(ke)隆(long)，即可檢測到0.1%細胞群體中發生的突變(bian)；
流程簡單
工作(zuo)流程簡單，深(shen)度的數據分析及可視化，一鍵構(gou)建細胞(bao)水平上突變圖譜、探索克隆(long)分布和(he)克隆(long)進化等，
實現DNA和(he)蛋白(bai)分(fen)析結果的共呈(cheng)現。
定制服務(wu)
可選擇已(yi)有的目錄化Panel，也可根據研究需求進(jin)行靶向DNA&蛋白(bai)質panel定制；
高性(xing)價比(bi)
與低(di)通量或傳統(tong)人工操作等(deng)方法相比，成本降低(di)數十(shi)倍；
經驗豐富
百奧醫藥技術團隊現已累積100余種不(bu)同組織(zhi)類型、數(shu)千余個樣品的單細胞測序經驗。
送樣要求
應用方向
應用案例
單細胞DNA測(ce)序揭示(shi)海綿狀(zhuang)血管(guan)畸形致病機(ji)制
PIK3CA and CCM mutations fuel cavernomas through a cancer-like mechanism
發表雜志：Nature （IF: 49.962）； 發表時(shi)間： 2021年 6月； 應用(yong)技術： Mission Bio 單(dan)細胞多組學測(ce)序
血管畸形如腦部海綿狀血管畸形（CCMs） 是年輕人中風和癱瘓的重要病因。對小鼠模型的研究結果顯示，同時存在KRIT1基因功能缺失和PIK3CA基因獲得性突變的小鼠發展出嚴重的CCM病變。通過對79個手術切除的CCM病變樣本的66個基因（包括CCM相關基因和PIK3CA）的bulk測序，發現人類CCM病變組織中也含有PIK3CA突變，并存在多個不同的突變位點。為了確定PIK3CA和CCM相關基因的體細胞突變是否出現在人類CCM的同一細胞中，本研究使用3個散發性和兩個家族性CCM進行了單細胞核DNA測序。結果表明，大多數突變細胞核包含所有已鑒定的CCM相關基因和PIK3CA體細胞突變，較少的細胞核顯示了每種可能的基因型組合。這說明， PIK3CA和CCM相關基因的體細胞突變發生在同一細胞中。此外，為進一步探究CCM的機制，本研究還利用小鼠模型對CCM中的信號轉導進行了研究。
GOF PIK3CA突變和LOF CCM突變在人類CCM的同一細胞中共存
