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BD Rhapsody單細胞3‘轉錄組測序
產品簡介
單(dan)(dan)(dan)細胞(bao)轉錄組測(ce)(ce)序如何進行單(dan)(dan)(dan)細胞(bao)的(de)捕獲，是決定單(dan)(dan)(dan)細胞(bao)檢(jian)測(ce)(ce)成本和通量的(de)關鍵步(bu)驟。高通量單(dan)(dan)(dan)細胞(bao)捕獲目前(qian)主流(liu)(liu)的(de)有兩大策(ce)略，一(yi)種是以10x Genomics為代表(biao)(biao)的(de)采(cai)用微(wei)流(liu)(liu)控(kong)芯片(pian)技術（Microfluidic） ，另(ling)一(yi)種，就是BD Rhapsody為代表(biao)(biao)的(de)采(cai)用微(wei)孔(kong)板（Microwell） 技術。 BD Rhapsody單(dan)(dan)(dan)細胞(bao)分(fen)析系(xi)統包括BD Rhapsody卡式芯片(pian)、 BD Rhapsody上樣臺(tai)、 BD Rhapsody掃描儀三大部(bu)分(fen)。
BD Rhapsody上樣臺（左）； BD Rhapsody卡式芯片（中(zhong)）； BD Rhapsody掃描儀(yi)（右(you)）
技術原理
BD RhapsodyTM 卡式芯片由上萬個微孔組成，主要承擔樣本以及試劑的添加，在平面卡式芯片上，一個細胞與一個條碼標記微球（beads） 依次落入同一個微孔中，細胞裂解釋放mRNA并且與磁珠上的引物序列雜交，進而完成細胞的捕獲和mRNA反轉錄。磁性回收beads，抓取cDNA進行文庫構建并測序。接下來采用BD RhapsodyTM 單細胞分析系統進行數據分析，一次可以獲得100~10,000個單細胞的基因表達數據，實現單細胞水平鑒定和表征細胞類型的目的。
BD Rhapsody 微(wei)孔(kong)捕獲及(ji)標記細(xi)胞(bao)原理
BD Rhapsody 單細胞測序(xu)實驗流程圖
BD Rhapsody 單細胞轉錄組測序
結果展示
細胞分群圖(tu)（左）； 蛋白(bai)表達(da)密度分布圖(tu)和熱圖(tu)分析（右(you)）
Marker 基因聚類熱(re)圖（左(zuo)）； 基因表達擬時間分析（右）
產品優勢
超高通量
每個(ge)樣可檢(jian)測100-10,000個(ge)細胞(bao)；
多組學檢測
可(ke)以同時實(shi)現靶向(xiang)mRNA+ 蛋白質+ VDJ CDR3的單(dan)細胞多組學(xue)研究；
系(xi)統可靠
可利用(yong)成(cheng)像(xiang)系統對單細(xi)(xi)胞捕(bu)獲(huo)過程(cheng)進行質控；單細(xi)(xi)胞捕(bu)獲(huo)效率高(gao)達80%，多細(xi)(xi)胞比(bi)例<1%(1,000個細(xi)(xi)胞中)；
經驗豐富
百奧(ao)醫藥技術團(tuan)隊現(xian)已(yi)累(lei)積(ji)100余種(zhong)不(bu)同組織(zhi)類(lei)型(xing)、數千余個樣品的單細胞(bao)測(ce)序經驗。
送樣要求
應用方向
應用案例
鼻(bi)纖毛細胞是(shi)COVID-19早期(qi)SARS-CoV-2復制的主要靶(ba)細胞
Nasal ciliated cells are primary targets for SARS-CoV-2 replication in the early stage of COVID-19
發表雜志：Journal Of Clinical Investigation （IF: 14.808）； 發表時間： 2021年 7月； 應(ying)用(yong)技術：BD Rhapsody單細胞轉錄組(zu)測序
在COVID-19的(de)(de)(de)(de)(de)早期階(jie)(jie)段(duan)，上呼吸道(dao)會受(shou)到損害，但在細(xi)胞水(shui)平(ping)上對SARS-CoV-2的(de)(de)(de)(de)(de)趨向性尚未(wei)完全確定。最近的(de)(de)(de)(de)(de)單細(xi)胞RNA-Seq分(fen)析(xi)顯示(shi)所有鼻上皮(pi)細(xi)胞中(zhong)(zhong)SARS-CoV-2進入相關宿主分(fen)子的(de)(de)(de)(de)(de)mRNA表(biao)達水(shui)平(ping)較(jiao)低，但本(ben)研究發(fa)(fa)現這些(xie)(xie)蛋白(bai)水(shui)平(ping)相對較(jiao)高，并且它們的(de)(de)(de)(de)(de)定位局(ju)限(xian)于多毛(mao)上皮(pi)細(xi)胞的(de)(de)(de)(de)(de)頂端(duan)。此外，本(ben)研究提供了(le)在COVID-19患(huan)者中(zhong)(zhong)大量檢測到SARS-CoV-2并在多分(fen)枝細(xi)胞中(zhong)(zhong)復制的(de)(de)(de)(de)(de)證據。研究發(fa)(fa)現，在COVID-19的(de)(de)(de)(de)(de)早期階(jie)(jie)段(duan)，感染的(de)(de)(de)(de)(de)纖(xian)毛(mao)細(xi)胞迅速被分(fen)化的(de)(de)(de)(de)(de)前體細(xi)胞取代。此外，分(fen)析(xi)表(biao)明SARS-CoV-2的(de)(de)(de)(de)(de)細(xi)胞趨向性僅限(xian)于鼻腔(qiang)纖(xian)毛(mao)上皮(pi)而非口腔(qiang)鱗狀(zhuang)上皮(pi)。這些(xie)(xie)結果表(biao)明，在COVID-19早期階(jie)(jie)段(duan)靶向鼻上皮(pi)纖(xian)毛(mao)細(xi)胞可能是預防SARS-CoV-2傳播的(de)(de)(de)(de)(de)理想策略。
健(jian)康供體與COVID-19患者鼻上皮(pi)細胞組(zu)成
差(cha)異表達基因分(fen)析（左(zuo)）； COVID-19患者鼻腔上皮細胞的軌跡推斷（右）
