-
BD Rhapsody單細胞5‘轉錄組+免疫組庫測序
產品簡介
單(dan)細(xi)(xi)胞轉錄(lu)組測序如何(he)進行(xing)單(dan)細(xi)(xi)胞的捕獲，是決定單(dan)細(xi)(xi)胞檢測成本和(he)通量(liang)(liang)的關鍵步驟(zou)。高通量(liang)(liang)單(dan)細(xi)(xi)胞捕獲目(mu)前主(zhu)流的有兩大策略，一種是以(yi)10x Genomics為代表(biao)(biao)的采用微(wei)流控芯(xin)片(pian)技術(shu)（Microfluidic） ，另一種，就是BD Rhapsody為代表(biao)(biao)的采用微(wei)孔板（Microwell） 技術(shu)。 BD Rhapsody單(dan)細(xi)(xi)胞分析系統包括(kuo)BD Rhapsody卡式芯(xin)片(pian)、 BD Rhapsody上樣臺、 BD Rhapsody掃(sao)描儀三大部分。
BD Rhapsody上樣臺(tai)（左）； BD Rhapsody卡式芯片（中）； BD Rhapsody掃描儀（右）
技術原理
BD RhapsodyTM 卡式芯片由上萬個微孔組成，主要承擔樣本以及試劑的添加，在平面卡式芯片上，一個細胞與一個條碼標記微球（beads） 依次落入同一個微孔中，細胞裂解釋放mRNA并且與磁珠上的引物序列雜交，進而完成細胞的捕獲和mRNA反轉錄。磁性回收beads，抓取cDNA進行文庫構建并測序。接下來采用BD RhapsodyTM 單細胞分析系統進行數據分析，一次可以獲得100~10,000個單細胞的基因表達數據，實現單細胞水平鑒定和表征細胞類型的目的。
BD Rhapsody 微孔捕獲及標記細胞原理(li)
BD Rhapsody 單細胞(bao)測序(xu)實驗流(liu)程圖
BD Rhapsody 單細胞免疫組庫測序
結果展示
細胞(bao)分(fen)群圖(tu)(tu)（左）； 蛋白表達密(mi)度分(fen)布圖(tu)(tu)和熱(re)圖(tu)(tu)分(fen)析（右）
Marker 基因聚類熱(re)圖（左）； 基因表達擬(ni)時間(jian)分析（右）
產品優勢
超高通量
每個(ge)樣可檢測(ce)100-10,000個(ge)細胞(bao)；
多組學檢測
可(ke)以同時實現靶(ba)向mRNA+ 蛋白質+ VDJ CDR3的單細胞多組(zu)學研究(jiu)；
系(xi)統可靠
可利用成像系統對單(dan)細(xi)胞(bao)捕獲過程(cheng)進行質控；單(dan)細(xi)胞(bao)捕獲效率高(gao)達80%，多細(xi)胞(bao)比例(li)<1%(1,000個細(xi)胞(bao)中)；
經驗豐富
百奧醫藥(yao)技(ji)術團隊現已累(lei)積100余(yu)種不(bu)同組織類(lei)型、數千(qian)余(yu)個樣品的單細胞測序經驗。
送樣要求
應用方向
應用案例
鼻纖毛(mao)細胞是COVID-19早期(qi)SARS-CoV-2復制的主要(yao)靶細胞
Nasal ciliated cells are primary targets for SARS-CoV-2 replication in the early stage of COVID-19
發表(biao)雜(za)志：Journal Of Clinical Investigation （IF: 14.808）； 發(fa)表時(shi)間： 2021年 7月； 應用技術：BD Rhapsody單(dan)細胞轉錄組測序
在(zai)COVID-19的(de)(de)早(zao)期(qi)階(jie)(jie)段，上(shang)呼吸(xi)道(dao)會受到損害，但在(zai)細(xi)(xi)胞水(shui)平(ping)上(shang)對SARS-CoV-2的(de)(de)趨向(xiang)性尚(shang)未完(wan)全確定(ding)。最近的(de)(de)單細(xi)(xi)胞RNA-Seq分析顯示(shi)所有(you)鼻(bi)上(shang)皮(pi)(pi)細(xi)(xi)胞中(zhong)(zhong)SARS-CoV-2進入相關(guan)宿主分子的(de)(de)mRNA表(biao)達水(shui)平(ping)較低，但本研究(jiu)發現(xian)這些蛋白水(shui)平(ping)相對較高，并(bing)且它們的(de)(de)定(ding)位局(ju)限于多毛(mao)上(shang)皮(pi)(pi)細(xi)(xi)胞的(de)(de)頂端(duan)。此外，本研究(jiu)提(ti)供了在(zai)COVID-19患者中(zhong)(zhong)大量檢測到SARS-CoV-2并(bing)在(zai)多分枝細(xi)(xi)胞中(zhong)(zhong)復(fu)制的(de)(de)證據。研究(jiu)發現(xian)，在(zai)COVID-19的(de)(de)早(zao)期(qi)階(jie)(jie)段，感染的(de)(de)纖(xian)毛(mao)細(xi)(xi)胞迅(xun)速被分化的(de)(de)前體(ti)細(xi)(xi)胞取代(dai)。此外，分析表(biao)明SARS-CoV-2的(de)(de)細(xi)(xi)胞趨向(xiang)性僅(jin)限于鼻(bi)腔纖(xian)毛(mao)上(shang)皮(pi)(pi)而非口腔鱗狀上(shang)皮(pi)(pi)。這些結果表(biao)明，在(zai)COVID-19早(zao)期(qi)階(jie)(jie)段靶向(xiang)鼻(bi)上(shang)皮(pi)(pi)纖(xian)毛(mao)細(xi)(xi)胞可能是預防SARS-CoV-2傳(chuan)播(bo)的(de)(de)理想策略。
健(jian)康供體(ti)與(yu)COVID-19患者鼻上(shang)皮細(xi)胞組成
差異表達基因分(fen)析(xi)（左）； COVID-19患者鼻腔上皮細(xi)胞的軌跡推斷（右）
